El INIAP tiene por visión ser el instituto de referencia regional en investigación, desarrollo e innovación, articulador y rector del Sistema Nacional de Investigación, Desarrollo Tecnológico e Innovación Agropecuaria, Agroindustrial y de Forestación Comercial del país. El trabajo del INIAP se enfoca a la generación e impulso de los procesos de investigación científica, el desarrollo tecnológico, la innovación y la transferencia de tecnologías para el sector agropecuario, agroindustrial, producción forestal orientadas a fortalecer la seguridad y soberanía alimentaria, el uso y manejo sostenible de los recursos naturales y la productividad sistémica en el territorio.